Najvyšší kontrolný úrad SR (NKÚ) na základe výsledkov kontroly zameranej na činnosť v roku 2002 vyčíta Ministerstvu dopravy, pôšt a telekomunikácií SR (MDPT), že nezabezpečilo splnenie splátkových povinností Slovenských aerolínií, a.s., a neuplatnilo zmluvnú pokutu z omeškania. Letecká spoločnosť totiž nezaplatila ministerstvu za prenájom lietadiel ani podľa dohodnutého splátkového kalendára, pričom celkový dlh k 31. decembru minulého roka predstavoval 93,8 mil. Sk. Informoval o tom na piatkovej tlačovej konferencii podpredseda NKÚ Igor Malý.
MDPT si podľa kontrolného orgánu vlani nesplnilo zákonnú povinnosť tiež tým, že neupozornilo Železnice Slovenskej republiky a Železničnú spoločnosť na ich povinnosť odviesť výnosy z prostriedkov štátneho rozpočtu (ŠR) na príjmový účet ŠR, ako o tom hovorí zákon o rozpočtových pravidlách. V roku 2002 sa kvôli tomu krátili príjmy ŠR o sumu 4,6 mil. Sk. Rezort dopravy podľa kontrolného úradu nemá ani ucelený prehľad o hospodárení a rozdeľovaní zisku spoločností, v ktorých má majetkovú účasť. Ide o firmy Metro, a.s., Slovenské aerolínie, a.s. a Poštová banka, a.s.
Ďalšie nedostatky na kontrolovanom ministerstve odhalil NKÚ v zabezpečení informačného systému, starostlivosti o počítače či v oblasti softvérového vybavenia počítačov. MDPT totiž bez náležitého vydokladovania faktúr a bez vykonania verejného obstarávania uhradilo za komplexné zabezpečenie informačného systému takmer 590 tis. Sk. Podobne bez protokolov o vykonaných prácach a službách uhradil rezort faktúry za starostlivosť o počítače v sume 478,2 tis. Sk. Ministerstvo navyše nemá evidenciu, na ktorom počítači je nainštalovaný aký softvér, takže sa nedá inventarizovať podľa zákona o účtovníctve.